先天性心臟病種類甚多，主要是因為胎兒在母親的體內時心臟肌肉和血管發育不正常，使心臟結構出現問題。但隨著出生率下降、以及產前檢查技術的改進，近年不論在外國已發展國家，或是香港，新病例亦有下降的跡象。以香港數字，每年新症約有500-600個，其中約200-300個嬰兒需要接受手術治療。
簡單而言，先天性心臟病最常見的兩大類是心室間隔缺損及心房間隔缺損。人的心臟分左右兩邊，各有一心房(左心房及右心房)及一心室(左心室及右心室)，且中間有一層間隔，令兩邊的心室和心房互不相通。在正常的心臟，左邊心臟的壓力會較右邊為高。若心臟發育不正常，左右間隔出現缺損(俗稱「心漏」)，血液便會由左邊的高壓處，流血右邊的低壓處，這些額外的血流量會加重心臟負荷，令心臟脹大，嚴重的可以引致心衰竭。
另外，若心臟右邊血液流量太多，血液有機會進入肺部，導致肺壓過高。因為人體肺壓只有血壓的20%，壓力過高容易令肺血管變粗、變厚及收窄，導致永久性破壞，形成「四聯症」。此症的危險之處在於當心臟右邊壓力增高，會同時抵銷左邊心臟的壓力。表面上，病人身體雖然沒有不適症狀，但心肺功能卻漸被破壞，最終導致心臟變大、肺壓增高，要進行心肺移植方能挽回正常的心肺功能。
不過，上述情況始終較為罕見，不少出生時有「心漏」的嬰兒，隨年紀長大，心臟的間漏處可自動癒合。但倘若嬰兒出生後容易氣促，食奶時出現嘔吐，增重較慢，都可能因心肺功能稍弱，影響進食所致，如出現此情況便應接受詳細檢查及適當的診治。
以往要替患上先天性心臟病嬰兒施以手術治療，因其身軀細小危險性高，若病情穩定，宜緊密觀察一段時間才作決定。但隨著手術儀器的改進，初生嬰兒接受手術的安全性亦已提升，如心房缺損的手術風險甚低，複雜一些的手術風險約20%，平均而言手術風險約4%。現時大部分嬰兒心肺手術都以開胸手術形式進行，心房間隔缺損開始可用導管技術，而心室缺損的導管手術，暫可用於小型、中型心漏病例，至於嚴重心漏，醫學界尚在鑽研相關技術。
